Ajtay Zénó középiskolai tanulmányait a szekszárdi Garay János Gimnáziumban végezte, 1989-ben a Pécsi Orvostudományi Egyetemen általános orvosi diplomát szerzett .

1994-ben belgyógyászatból, 1998-ban kardiológiából  2011-ben kardiológiai rehabilitációból szakvizsgázott.

1989-től 1999-ig a Kaposi Mór Oktató Kórház I.számú Belgyógyászati Osztályán dolgozott, majd 1999-ben az akkor megalakuló Szívgyógyászati Klinikára hívták, aminek egyik alapító tagja volt.

Tudományos érdeklődésének középpontjában a revaszkularuzációs eljárásokat követő (PCI; CABG) kognitív funkcióváltozások, valamint az endothel dysfunctio áll. A szívműtéteket követően kialakuló agykárosodás vizsgálata több előadásnak és közleménynek adta témáját. Ezen kívül a non-invazív kardiológiai vizsgálómódszerek, elsősorban az echocardiographia és billentyűbetegségek képezik főbb kutatási területét. Transthoracalis echocardiographiából II. szintű és transoesophagiális echocardiographiából III. szintű licensszel rendelkezik.

A Magyar Kardiológusok Társasága tagja, az éves nagygyűlések rendszeres előadója.

2009-ben egészségügyi manager kurzus a PTE Közgazdasági karán, a  diploma munka címe: “Magánrendelések szervezeti és finanszírozási specialitásai Magyarországon”

2010 dec 13 sikeres (100%) Phd védés . Cím: ADMA változása revaszkularizációs eljárások során.

2014 október 1.-től dolgozik Harkányban a Zsigmondy Vilmos Gyógyfürdőkórházban, ahol a kardiológiai rehabilitáció vezetéséért, annak bővítéséért felel. Emellett orvos igazgató helyettesként a krónikus belgyógyászat, kardiológiai és belgyógyászati ambulanciák működését is felügyeli.

2015 1úlius 1.-én a Pécsi Tudományetem Szenátusa  c. egyetemi docensi címet adományozott.